晋升中将两月后，王喜斌离开北京军区，于2007年9月调任国防大学校长。国防大学是中国最高军事学府，是中国军队唯一的一所高级合同指挥院校，直属中央军委领导，担负着培养陆、海、空军指挥干部等任务。担任国防大学校长两年多后，王喜斌于2010年7月晋升上将军衔。
王喜斌究竟涉及哪些职务犯罪问题?对此，官方没有披露任何信息。2012年8月接受媒体采访时，王喜斌曾如此“解读”自己从普通战士到上将的经历，“有过徘徊,经过考验,受过成败得失的挑战,如果说我能够走到今天的话,不是一帆风顺的,而是在曲折当中,逐步发展的。”
